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[Minuta de carta de D. João III ao Comendador-Mor sobre o resgate de presos de Mascate]
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[Carta do rei Dom João III para o comendador-mor sobre a imposição do cardinalato ao Infante Dom Henrique]
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[Carta de Dom João III para o comendador-mor sobre a eleição para cardeal do Infante Dom Henrique, 1543]
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[Carta de Dom João III para o comendador-mor sobre uma ocorrência com um herege, e a necessidade do Santo Ofício da Inquisição, 1543]
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[Carta do rei Dom João III para o comendador-mor sobre a legacia de Portugal para o cardeal-infante Dom Henrique e outros assuntos]
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[Carta de D. João III ao Rei de Fez sobre a saca de cavalos]
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[Carta do rei Dom João III para o comendador-mor, sobre a prisão de Vasco Palha, em Constantinopla, e dum judeu, em Ancona, de Setembro de 1553]
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[Carta para Dom João III sobre uma viagem]
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[Carta de Dom João III para o comendador-mor referindo as notícias que lhe mandara o Vice-rei sobre os perigos que corre a Índia, para que as transmita ao Papa, Setembro 1553]
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[Carta de Dom João III para o comendador-mor em favor de Bernardim Esteves, Desembargador da Casa da Suplicação, Juiz dos Feitos da Fazenda, que estava em Roma]
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[Minuta da carta de Dom João III para Diogo de Azevedo sobre Lentes que hão-de vir ensinar na Universidade]
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[Carta de D. João V de padrão de 20 mil reis de tença anual a favor de Francisco Caetano Prestes da Silva, filho de Nuno Prestes da Silva, por nele ter renunciado o dito seu pai]
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[Carta do Rei de Fez a D. João III informando-o da chegada a Fez de Jacob Rosales]
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[Carta para Dom João III sobre o abandono de Safim e Azamor. Setúbal, 8 de Outubro de 1534]
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[Carta do Cardeal da Mota para D. João V remetendo minutas e despachos]
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[Carta do Beneficiado António Baptista ao Cardeal João da Mota e Silva sobre o preenchimento de minutas]
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[Carta de Dom Fernando, Bispo de Lamego, para Dom João III sobre o abandono de Safim e Azamor]
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[Lembrança de Frei Manuel Prestes sobre os motivos que determinaram a sua secularização]
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[Carta do Beneficiado António Baptista ao Cardeal João da Mota e Silva sobre a aprovação da minuta inclusa]
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[Treslado da carta que Luís Falcão escreveu a Dom João III com notícias de Diu]
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[Carta do Beneficiado António Baptista ao Cardeal João da Mota e Silva sobre a correcção de minutas e credenciais]
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[Carta de Diogo Mariz, sobre várias coisas tocantes ao estado da India, escrita a El-Rey Dom João III. Goa, 13 de Novembro de 1529]
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[Carta particular do Príncipe D. João, filho de D. João III, a seu pai]
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[Carta do Beneficiado António Baptista ao Cardeal João da Mota e Silva sobre a correcção da minuta da carta para D. Luís da Cunha]
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[Treslado de uma carta que foi para sua alteza em Fevereiro de 1541 sobre a capitania da nau de João Rebelo]
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[Carta de Bastião de Vargas para o rei sobre vários assuntos de Marrocos, 9 de Dezembro de 1540]
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[Carta régia para António de Saldanha, embaixador junto de Carlos V, sobre o casamento da Infanta Dona Maria com o Príncipe Dom Filipe de Espanha, 1546]
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[Carta de Crisma, dando conta a El-rei Dom João III do prejuízo que fazia à sua real fazenda ter feito mercê dos palmares de Goa à Câmara, pela diminuição do rendimento da arraia que deles se fazia, 15 de Novembro de 1529]
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[Carta régia para António Saldanha sobre as relações com a França]
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[Instruções da parte do rei para Dom Francisco Lobo que vai a Espanha, 1 de Novembro de 1539]
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[Carta de Dom Fernando, Bispo de Lamego, para Dom João III sobre o abandono de Safim e Azamor]
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[Carta régia para Cristôvão de Sousa a fim de se dar conta ao Papa do desastre de Santa Cruz do Cabo de Gué, 1541]
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[Carta do Conde da Castanheira, Dom António de Ataíde, para Dom João III, sobre umas instruções secretas a mandar a Paulo Moniz. Lisboa, 14 de Fevereiro de 1533]
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[Carta do Conde da Castanheira, Dom António de Ataíde, para Dom João III, sobre a fuga dos irmãos Diogo Pinto e João Pinto. Lisboa, 7 de Outubro de 1533]
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[Carta régia para Álvaro Mendes de Vasconcelos sobre as relações luso-francesas e a pirataria francesa. Évora, 1536]
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[Carta para Dom João III sobre o abandono de Safim e Azamor. Setúbal, 8 de Outubro de 1534]
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[Carta para Dom João III sobre uma viagem]
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[Carta de Dom Diogo de Sousa para Dom João III sobre um combate com os mouros e as necessidades de munições na praça de Mazagão, 25 de Janeiro de 1542]
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[Carta régia para o correio-mor, mandando-o investigar as culpas de Pedro Anes que levantava dificuldades aos correios, negando-lhes cavalos de posta. Lisboa, Novembro de 1552]
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[Carta do Conde da Castanheira, Dom António de Ataíde, para Dom João III, sobre as providências a tomar por causa da pirataria]
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[Carta do rei Xarafo referindo ao rei a feliz viagem que teve para Goa, onde chegou a salvamento com toda a armada e o governador Dom João de Castro, de quel recebera muitas honras e de toddos os portugueses. Goa, 8 de Outubro de 1545]
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[Treslado da carta que Luís Falcão escreveu a Dom João III com notícias de Diu]
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[Carta de Cosme de la Feita para o rei, comunicando-lhe que apenas poderá emprestar à coroa a prata e o ouro do serviço de sua casa, que valerão mil cruzados. Lisboa, 22 de Novembro de 1535]
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[Carta régia para Álvaro Mendes de Vasconcelos sobre as pretensões ao cardinalato do arcebispo Dom Martinho de Portugal, 1536]
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[Carta régia para Álvaro Mendes de Vasconcelos sobre a vinda do embaixador Honorato de Caire e o projeto de casamento da Infanta Dona Maria com o Delfim, Évora, 22 de Outubro de 1535]
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[Carta de Gaspar de Carvalho, administrador do arcebispado de Braga, para o rei Dom João III, sobre as igrejas de Erveredo. Braga, 6 de Julho de 1542]
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[Carta de Gaspar de Carvalho, administrador do arcebispado de Braga, para o rei Dom João III, sobre a vacatura da igreja de São João de Trastarcio, e as pretensões do Duque de Bragança. Braga, 25 de Junho de 1542]
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[Carta de Dom João de Castro para o rei sobre a viagem de Dom Estêvão da Gama ao Mar Vermelho. Goa, Outubro de 1541]